呼吸方法要根据患者的病情、体质、习惯，以及所练功种的不同，合理地进行选择。这样才能保证练功的顺利进行，获得练功效果。
自然呼吸法，是人们按照自己原来的呼吸方法及呼吸频率（每分钟16～18次）进行呼吸。
一般说来，自然呼吸法，多适用于初练气功者，或体质较弱，有心肺疾患的病人。尤其心肺功能不全者，必须采用自然呼吸的方法，以免增加心肺的负担。
在自然呼吸的基础上，呼吸次数逐渐减少，频率减慢，呼吸深度渐渐加深的呼吸方法，称为深呼吸法。在练习太极气功和十段锦时，多采用深呼吸的方法。
逆呼吸法，多用于正常人，或者体质较好的患者。这种呼吸方法，对有神经系统疾病的患者效果较好。室外活动常采用这种呼吸方法，可以较大幅度地排出二氧化碳，吸进新鲜的氧气，有助于身心健康。
内养功的呼吸方法，简要概括如下。内养功第一呼吸法：吸气——停闭——呼气，可以兴奋交感神经，具有抑制胃肠蠕动，升高血压的作用，临床多用于溃疡病、低血压、腹泻等患者。第二种呼吸法，吸气——呼气——停闭，可以加强副交感神经的兴奋性，具有增强胃肠蠕动，降低血压的作用，临床常用于胃下垂，消化不良，便秘及高血压等患者。
在练气功时，大多采用鼻吸鼻呼法或鼻吸口呼法，这样更符合人的生理及卫生的要求，因为鼻腔可以起到过滤、湿润、和加温空气的作用。而口吸鼻呼法较少采用。
