过去很少注意这方面的问题，近年来的研究发现，无症状的菌精症可导致自然流产，10%～15%的男性生殖道内存在着无症状的感染，即精液中含有一定数量的细菌，这种感染可以影响受孕的妇女，使胚胎流产，活动的精子可以传送细菌，干扰精卵结合与着床，细菌的种类有粪链球菌、白色葡萄球菌、大肠杆菌、α链球菌及厌氧性细菌等。
此外，父方职业性接触有害因素，如热、放射线、某些化学物质和金属，均能引起精子损害。现已证实，诱发精子基因突变是早期流产原因之一。
睾丸每日产生数以百万计的精子，最终在附睾中成熟。精子生成约需74天，细胞均处于分裂过程中，极易受到公害因素的损伤，特别是化学物质，虽然存在血一睾屏障，能选择性地调节体液成分和曲细精管上皮之间化学物质的通透，但仍然有不少物质可以通过，引起精子损害，致受精卵发育不良。精子核内的染色体承载着人类个体的遗传密码，当人类精子与卵子结合形成受精卵时，精子即将核内的遗传信息传递给子代，保证胚胎发育。因此，精子染色体畸变或精子核不成熟，均可导致胚胎发育异常或终止，是造成女性流产的最常见的男方因素。精子染色质脱氧核糖核酸完整性检测，是评价精子核功能状况的新方法之一。
引起精子脱氧核糖核酸不稳定的因素包括：
(1) 环境因素：如高温、挥发性化学气体（包括汽车尾气、油漆）、噪声、辐射等。
(2) 接触化学物品：如苯、汞、镉、农药等。
(3) 疾病因素：如精索静脉曲张、肿瘤、变态反应性疾病、持续发热等。
(4) 药物因素：如抗肿瘤化疗药物、皮肤病药物（免疫抑制类药物）等。
(5) 感染因素：如睾丸炎、菌精症等。
(6) 不良生活嗜好：如过度吸烟、酗酒、吸毒等。因此，在妻子受孕前3个月，丈夫要禁酒戒烟。
(7) 精神因素：如人体长期处于精神紧张状态，思想负担重，工作压力过大或情绪不稳定有焦虑、恐惧心理等。
人精子染色质脱氧核糖核酸不完整，可以导致不孕、流产。然而，此时的精液常规、精子形态及精子染色体可能并未出现异常表现，因此很容易被人遗漏和忽视。所以，精子脱氧核糖核酸完整性检查的目的在于了解当前男性精子的状态，是否适合受精。它和精液常规一起检查，可以更全面了解男性的生育能力，预测胚胎的发育。
